№ раздела

Наименование разделов и тем

Кол-во акад. часов

Вид занятия

1. Особенности методик регистрации биохимических и физиологических процессов в одиночной клетке

1.1

Особенности методик регистрации биохимических и физиологических процессов в одиночной клетке. Обзор актуальных методов

1

Лекция

2. Интерпретация результатов анализа 3’-концевого scRNAseq

2.1

Основы интерпретации результатов анализа 3’-концевого scRNAseq. Практическая интерпретация таких данных как экспрессия генов, траектории развития, латентное время, RNA-velocity, регулоны, и их соотнесение с результатами «мокрых» методов.

2

Лекция

3. Базовые принципы работы с живыми клетками с использованием флуоресцентной микроскопии

3.1

Базовые принципы флуоресцентной микроскопии. Особенности работы с живыми клетками в режиме реального времени

1

Лекция

3.2

Практический курс освоения работы на флуоресцентных микроскопах Nikon Eclipse Ti2 и Leica DMI6000

4

Практические занятия

4. Регистрация биохимических процессов и внутриклеточной сигнализации с использованием флуоресцентной микроскопии на уровне одиночных клеток

4.1

Теоретические основы внутриклеточной сигнализации в клетках млекопитающих.

2

Лекция

4.2

Теоретические основы использования клеточных красителей сигнальных молекул и генетически-кодируемых флуоресцентных биосенсоров

2

Лекция

4.3

Практический курс по регистрации ответов клеток на гормоны и внутриклеточной сигнализации на уровне единичных клеток с использованием клеточных красителей, регистрирующих внутриклеточный кальций

8

Практические занятия

4.4

Практическое освоение принципов использования генетически-кодируемых флуоресцентных биосенсоров на цАМФ и пероксид водорода.

8

Практические занятия

4.5

Практический курс по обработке данных микроскопии по регистрации внутриклеточной сигнализации с использованием клеточных красителей и флуоресцентных биосенсоров

4

Практические занятия

5. Регистрация физиологических ответов клеток с использованием флуоресцентной микроскопии

5.1

Теоретические основы функциональных ответов клеток на действующие вещества: дифференцировка, миграция, пролиферация. Особенности и подходы к регистрации функциональных ответов на уровне единичной клетки

3

Лекция

5.2

Практический курс по регистрации миграции и пролиферации клеток в режиме реального времени.

12, два дня

Практические занятия

5.3

Практический курс по обработке данных микроскопии по регистрации миграции и пролиферации клеток.

3

Практические занятия

6. Требуемое оборудование для проведения анализа на уровне единичных клеток

6.1

Перечень и технические характеристики минимально необходимого оборудования для проведения анализа на уровне единичных клеток.

2

Лекция

Итого:

52 акад. часа